Un examen a révélé "une blessure musculaire à la partie antérieure de la cuisse droite", indique le club champion d'Allemagne sur son site internet. "Boateng sera dans tous les cas remis pour le début de la préparation de la saison prochaine".
L'international allemand a manqué une bonne partie de la saison à cause d'une blessure musculaire contractée lors de l'Euro-2016 en France, puis de problèmes aux adducteurs, et enfin d'une opération de l'épaule.
Il n'a joué que 13 des 34 matches de Bundesliga cette saison, dont six seulement durant 90 minutes.
Samedi contre Fribourg, il avait dû sortir à la 11e minute après un choc avec un joueur de Fribourg.
Jerome Boateng ne figurait pas dans la liste des 23 joueurs retenus pour jouer la Coupe des confédérations avec l'Allemagne (17 juin - Juillet en Russie), le sélectionneur Joachim Löw ayant décidé de laisser ses cadres au repos.